故事一开始，伊森·亨特在得到了一把神秘的人工智能武器钥匙后，故意伪装成 CIA局长的助手，混进了一场关于美国情报机构对这把武器的看法的会议。伊森得到了想要的情报后，用麻醉剂将警长尤金·基特里奇打晕。这个情节和技巧，就像是《碟中谍:叛逆帝国》里，以伊森为首的小队，在与英国首相和6号特工交手时，从他们那里得到了反间谍机构 Syndicate的资料，这也是第一个彩蛋，可以说是非常经典的一部分！

伊森混进了情报部门的高层会议，在露出真面目之前，他先用一颗大面积的烟雾弹将所有高层都打晕了过去，但为了让自己和基特里德保持清醒，伊森还戴上了一个特殊的防毒面具。

《碟中谍:死亡清算上集》是在瘟疫爆发时拍摄的，汤姆·克鲁斯等人在威尼斯拍戏时，曾被国外媒体拍到过他戴着面具的画面，而汤姆·克鲁斯戴着的面具，与影片中的面具一模一样，但造型却更加科幻。

打火机在特工片里很常见，但在《碟中谍》里，由于影片开场海报经常用到了经典的爆炸物导火索，因此打火机引燃导火索的桥段就更加经典了；而且，在这部电影里，登喜路也是一个很好的标记，用来证明自己的身份。

在《碟中谍:死亡清算上集》中，一只只美国 Zippo系列的打火机，也成了伊森·亨特的重要道具，虽然它们并不能完全派上用场，但它们却成了伊森·亨特的标志，而“卡特队长”海莉·阿特韦尔，则是新加入的海莉·亨特，她并不知道伊森的名字和身份，但她对她的态度，就像对自己的亲人一样，这也是她和伊森的特殊关系。

只要是看过《碟中谍》的人，都会对眼镜这种东西留下深刻的印象。在影片中，眼镜、隐形眼镜和太阳镜扮演了许多不同的角色，如摄像、实况、追踪和传递任务讯息等。

在这一集中，伊森·亨特戴上的墨镜，不仅保留了面部识别的能力，还可以对特定的物体进行定位，甚至还可以对情报人员发送过来的资料进行读取，不仅让汤姆·克鲁斯看起来更加英俊，而且可以说是继承了上一部作品的最大优点！

易容面具，可以说是《碟中谍》中最经典也是最原始的秘密武器，当汤姆·克鲁斯摘下面具，露出真容时，粉丝们都会情不自禁地欢呼！从1996年开始，《蒙面逆向制作技术》在剧情中不断进步。第一集中，当后勤探员们将目标面部轮廓倒出来之后，技术员们还得给面罩上颜色、贴胡子之类的化妆要素；到了那个时候，易容面具的制造机，已经可以在几分钟之内完成，并且喷涂油漆和其他材料。在上一部《碟中谍:叛逆之谜》中，易容面具的制造者们，已经采用了3D打印的方法，用溶液来制作面具。

在这里，许多人都要用到易容面具，而且新的面具制造者也被压缩到只有一个行李箱那么大。影片中，伊森·亨特除了以易容身份混进智囊团，同时也要为伊森·亨特和格雷斯制作面具，和一个神秘的目标做生意。但在这个节骨眼上，就像是《碟中谍:鬼影约章》的第四部那样，易容面具翻转机肯定会失效！让这个任务变得更加困难！

在这部电影中，格雷斯扮演的是“卡特队长”海利·阿特韦尔，她不仅是个职业小偷，还是个骗子，她的犯罪记录比电话本还多。在电影里，格雷斯的小偷技术很好，就连伊森·亨特这种做了很多年间谍的人，都被她偷走了很多重要的东西，而且格雷斯的技术简直就像是变戏法一样！这就是《碟中谍》的第一部，让汤姆·克鲁斯的魔术师重新出现在这个世界上！

第一集，汤姆·克鲁斯以“魔术手法”从 CIA的档案室里偷出了一份情报，并将其保存在一张硬盘里，但由于吉恩·雷诺扮演的情报不够忠诚，伊森装模作样地说自己用魔法把这张硬盘给偷了出来，并不停地演示魔法，这就是第一集的经典情节。

上一期的“白寡妇”，由瓦妮莎·柯比扮演，她是一个神秘的军火商，也是一个超级大国的中间人，在一次聚会上，她提到了自己是从母亲那里继承来的产业，但并没有说出她的母亲是谁。不过，白寡妇的身份，却在这一部《碟中谍:死亡清算上集》中被揭开了！

故事里，白寡妇和她的手下们坐上了大名鼎鼎的“东方快车”，和一个神秘的男人做了一笔交易，这个男人是第一个出场的男人，但他却告诉白寡妇，上次在巴黎见到她时，她比这次要矮得多。同时，他还向白寡妇表达了对她母亲的感激之情，并透露了她母亲就是《碟中谍》第一集的军火商 Max！更有意思的是，在第一集里，基特里奇局长也是在火车上逮捕麦克斯的，两人还打着做生意的旗号，这是对原著的一种尊重，也是这部电影最大的惊喜！

在影片的最后，由于大桥被炸断，“东方快递”失去了控制，变成了一辆辆卡车，掉入了桥下的河里，汤姆·克鲁斯和海莉·阿特韦尔从前面跑到了后面，场面很是激烈！在那辆被吊在半空中的列车上，两个人都是沿着扶手往上爬的，就像是《碟中谍2》里的伊森在岩石上攀爬，或者《碟中谍:鬼影约章》里的哈里发塔一样，都是电影历史上的经典情节，只不过更加惊心动魄而已！

在《碟中谍:死亡清算上集》中， Benji和 Lurther这两位计算机天才，为了对付“一个体”，不得不使出浑身解数，与人工智能展开了一场激烈的较量，这场较量中，还包含了黑客技术。在影片中，情报人员之间的通讯、定位跟踪、通讯都是通过卫星技术进行的，当“一个体”连续中断卫星联系的时候，本吉与勒瑟两人，便冒险骇进一颗俄罗斯废弃的卫星，以其为媒介，与伊森建立了联系。

在《碟中谍:鬼影约章》的大结局中，伊森和本季等人勾引了一位印度媒体大亨，潜入他的房间，偷了一颗卖掉的俄罗斯废弃军事卫星，阻止他们向俄罗斯发射核武器。而在《碟中谍:叛逆帝国》中，汤姆·克鲁斯在一场令人瞠目结舌的表演中，赤手空拳地从一架飞机上爬下来，试图阻止一颗生化武器的发射，而本杰明则让负责后勤的布兰德帮忙，窃取一颗俄罗斯的卫星。在这里，这一集又一次对俄罗斯军队的调侃，也是对上一部作品中经常出现的“后备方案”的一种表示敬意。

《碟中谍:死亡清算上集》的中篇，英国间谍伊尔莎·费斯特，在威尼斯的一座狭长大桥上，与加百列展开了一场生死搏杀，两人一人一剑，一人一刀，一人一拳，最终伊尔莎·费斯特，在艾森赶到支援之前，被加百列杀死。

在此之前，伊尔萨还在《碟中谍:叛逆帝国》中和著名的“骨科医生” Bone博士，用匕首进行了一场近身肉搏。那一次，伊尔萨以受伤的方式获胜，用一记“缠住”，然后一剑刺穿了一名外科医生的脖颈。可惜的是，在与加百列的战斗中，伊尔萨两次想要使用这一招，都被对方一一化解，最终落败身亡。